84 CADERNOS DE ANÁLISE E PROSPETIVA CULTIVAR N.º 30 ABRIL 2024 – Melhoramento e técnicas genómicas resultar em animais/efetivos mais viáveis e contribuir para uma diminuição da pobreza nas zonas rurais. Considerações finais A associação da diversidade fenotípica com a variabilidade genética subjacente é agora grandemente facilitada pelo desenvolvimento das tecnologias de sequenciação e dos métodos de análise genómica. A combinação de dados genómicos obtidos para as várias espécies de animais domésticos, e em particular para as raças autóctones, com abordagens inferenciais/métodos de análise probabilísticos deverá abrir perspetivas de investigação inovadoras e originais. Esta é, a nosso ver, uma ótima oportunidade para desenvolver projetos de investigação interdisciplinar entre laboratórios ibéricos para obter estes genomas, identificar os métodos mais adequados para analisar os dados de sequenciação genómica e ultrapassar as limitações computacionais que lhes estão inerentes, de forma a garantir uma utilização sustentável e continuada dos recursos genéticos de animais domésticos localmente adaptados. Exemplo de um projeto integrado de utilização de ferramentas genómicas OPTIBOV: Caracterização genética de populações de bovinos para um desempenho otimizado nos ecossistemas africanos O OPTIBOV8 é um projeto ERA-Net Cofund aprovado no âmbito do programa LEAP-Agri9,10, uma iniciativa conjunta Europa-África de Investigação e Inovação no domínio da Segurança Alimentar e Nutricional e da Agricultura Sustentável. O projeto teve início em setembro de 2018 e terminou em agosto de 2022, mas o vasto conjunto de dados recolhido terá impacto na investigação da equipa a longo prazo. Estão a ser desenvolvidos estudos de associação genómica com base em fenótipos bem definidos em condições locais. O que torna o OPITIBOV único e inovador é o facto de estes fenótipos terem sido recolhidos a partir de ecótipos específicos, em condições locais, em vários países e continentes, com os seus próprios fatores de stress. A ideia principal subjacente ao projeto foi gerar estes dados ao longo de um transecto Norte-Sul através da amostragem de raças bovinas na Finlândia, nos Países Baixos, em Portugal, no Egipto, no Uganda e na África do Sul. No total, foram amostrados cerca de 500 animais de 26 raças autóctones e a raça comercial Holstein-Frísia comum a todos estes países. Está a ser utilizada uma combinação de dados de sequenciação genó8 https://subsites.wur.nl/en/optibov-project.htm 9 https://cordis.europa.eu/project/id/727715 10 https://leap-agri.com/?page_id=291 11 https://doi.org/10.4060/cc3079en mica, expressão génica, do microbioma e informação fenotípica para identificar biomarcadores de características de adaptação, resiliência e resistência a doenças. O projeto centrou-se nos pequenos agricultores e no conhecimento destes criadores locais. Foram estabelecidos contactos e reuniões com associações de criadores para identificar os interessados em participar e preparar a partilha de materiais e dados entre os parceiros do OPTIBOV de acordo com o Protocolo de Nagoya. Foram organizadas reuniões do projeto na África do Sul, no Uganda e no Egito para promover a formação dos agricultores, jovens cientistas, promotores rurais e associações de criadores relativamente aos protocolos de recolha de amostras e fenótipos, bem como à análise de dados. A equipa portuguesa elaborou folhetos em várias línguas, com contributos de todos os parceiros, para anunciar e divulgar o projeto. A Universidade de Wageningen, nos Países Baixos, mantém um banco centralizado de duplicados das amostras recolhidas durante o OPTIBOV. Em Portugal, constituiu-se um banco de amostras para as três raças autóctones incluídas neste projeto – Barrosã, Mirandesa e Mertolenga (para além do banco de amostras já estabelecido pela nossa equipa para a grande maioria das raças bovinas autóctones portuguesas, bem como canídeos e algumas raças ovinas). Desenvolveram-se e testaram-se métodos bioinformáticos que estão a ser utilizados para as análises de dados. Estão, também, a ser construídos genomas de referência com base em fragmentos de sequenciação longa (long reads) para as 26 raças autóctones, o que constitui um conjunto de dados único para a identificação de biomarcadores associados a adaptação. Pretende-se analisar o potencial de melhoramento do desempenho produtivo, mantendo a biodiversidade e considerando os fenótipos adaptativos. Estão ainda em curso análises dos perfis de expressão génica ao nível do sangue num conjunto de animais de cada raça, com o objetivo de avaliar o seu estado imunitário. A análise do microbioma das amostras fecais destes animais permitirá tirar conclusões sobre o seu estado de saúde, mas também fornecerá informações sobre as emissões de gases com efeito de estufa nos vários ecossistemas. Os resultados da nossa investigação podem ser comunicados aos decisores políticos através de relatórios técnicos, tal como aconteceu no que respeita às orientações técnicas11 publicadas em 2023 pela Organização das Nações Unidas para a Alimentação e a Agricultura (FAO), com o contributo de vários investigadores do projeto OPTIBOV. Agradecimentos As autoras agradecem às associações de criadores e aos produtores pela sua colaboração ao longo dos anos. Agradecemos, também, aos colegas Lounès Chikhi, Gabriel Marais e Raquel Tavares pelos proveitosos debates sobre biologia evolutiva e genética de
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