Biodiversidade dos animais domésticos da Península Ibérica: uma perspetiva genómica 81 lações crioulas atuais (Ginja et al. 2020). Este estudo estabeleceu as bases para um possível programa de âmbito continental para a caracterização, a conservação e o reconhecimento das raças bovinas ibero- -americanas, sendo ainda necessárias análises genómicas desse património. A caracterização genómica é fundamental para compreendermos os processos demográficos e de diferenciação histórica destas raças responsáveis pelos padrões de diversidade observados. Por exemplo, uma primeira análise de genomas de oito raças de bovinos Ibéricos autóctones revelou uma forte influência de raças taurinas africanas, incluindo a partilha de haplótipos de ADN mitocondrial (mtDNA) e do cromossoma Y de diversas origens (Da Fonseca et al. 2019). Curiosamente, neste estudo foi detetada uma diferenciação muito baixa do cromossoma X em relação aos autossomas em todas as raças taurinas analisadas, o que poderá ser resultado de um fluxo genético maioritariamente mediado por touros. Na espécie bovina, os processos de cruzamento e de diferenciação histórica foram complexos e resultaram em níveis de diversidade genómica inesperadamente elevados em raças autóctones de distribuição geográfica relativamente limitada. Nos países mediterrânicos, é provável que isto esteja associado às práticas tradicionais de seleção e comercialização animal, no entanto está ainda por esclarecer em que medida isso também se aplica a outras espécies de animais domésticos deste território. No que respeita às ovelhas autóctones de tipo Merino e Bordaleiras (lã intermédia), um dos primeiros estudos genómicos indica que estas raças não estão geneticamente comprometidas, no sentido em que apresentam moderada diversidade e baixa consanguinidade (Gaspar et al. 2023). A análise da estrutura genética revelou ainda que as ovelhas Merino Ibéricas formam um grupo bem diferenciado, o que é consistente com os registos históricos da sua origem local. Os estudos genómicos permitem identificar polimorfismos de uma única base nucleotídica (SNP, do inglês Single Nucleotide Polymorphism) que são úteis para inferências sobre a ancestralidade das diversas raças de animais domésticos, bem como para análises de cruzamentos entre raças específicas. Estes estudos constituem uma ferramenta essencial para proceder à rastreabilidade de produtos de qualidade certificados com denominação de origem, mas também para análises de associação genómica entre variabilidade genética e diversidade fenotípica (GWAS, do inglês Genome Wide Association Studies). Revela-se assim fundamental apoiar uma investigação multidisciplinar e colaborativa, que envolva investigadores, agências governamentais e a sociedade civil (por exemplo, associações de criadores), para uma utilização sustentável e continuada do património genético e cultural associado às raças autóctones de animais domésticos, de forma a promover a utilização de ferramentas de biologia molecular e bioinformática adequadas à gestão e caracterização da biodiversidade que lhes é inerente. O desenvolvimento das tecnologias de sequenciação genómica (HTS, do inglês high-throughput sequencing) revolucionou o campo da genética de populações/melhoramento genético animal, permitindo que os processos evolutivos sejam estudados com uma resolução sem precedentes e a sua utilização cada vez mais generalizada para fazer face aos desafios climáticos. No entanto, para muitas raças autóctones ibéricas estes dados ainda não existem, pelo que é necessário implementar atividades de formação e de divulgação científica para sensibilizar as autoridades (e.g., Direção-Geral de Alimentação e Veterinária – DGAV), associações de criadores, entre outros, para a utilidade de obter este tipo de informação. A recolha de dados de sequenciação genómica à escala populacional para as raças ibéricas poderá ajudar a ultrapassar as limitações inerentes à utilização de marcadores moleculares clássicos (e.g., STR autossómicos “neutros”), nomeadamente na identificação e genotipagem de variantes estruturais eventualmente associadas a características fenotípicas de interesse como sejam as que estão envolvidas na resposta ambiental, imunitária e de resistência a doenças. É possível complementar dados de sequenciação de fragmentos curtos (short-reads) e longos (long-reads), de menor e maior custo por amostra, respetivamente, de forma a rentabilizar estas tecnologias. Podemos, por exemplo, utilizar genomas de alta qualidade como referência para as
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